Also ein gstreamer Image auf ffmpeg umbauen wird nichts...
HDMU hat gegenüber PKT durchaus "Bildschwächen"...

Solltes es bei Dir nicht um laden von Dateien über das Netzwerk geht, sondern direkt von der HDD an der USB, kann ich Dir auch einmal einen Blick hier hin empfehlen:
[Sti7162-E2] Datendurchsatz im Heimnetz: CIFS vs NFS
"ohne zu stocken" ist hier das Stichwort, denn
[Sti7162-E2] Datendurchsatz im Heimnetz: CIFS vs NFS
" Dachte ich mir, denn teste doch mal das ursprünglich mit dem IDE-Case ausgelieferte USB-Kabel, schön dick...
Pustekuchen, Datenrate ging runter und es kam zu Aussetzern!!!"
Wenn Du also mit Deiner Kiste im Netzwerk hängst (oder die per Kabel mal ran hängen kannst) wäre das auch noch eine Möglichkeit zu testen, ob dort evtl. eine Schwierigkeit vorliegt, denn mich macht stutzig, das Du offensichtlich so konsequent Probleme mit den VideoFiles (nur mkv? evtl. ab welcher Dateigröße? ) hast...

OSCam: auch wenns es nicht die aktuellste ist (t37?) so findest Du doch hier schon einmal einen Anfang und alle notwendigen Infos
OScam-Ymod_for_PKT